בשנת 1996 הוא עבר לעבוד בחטיבה הפסיכיאטרית בבי"ח שיבא, שם הוא מכהן כיום כמ"מ מנהל מחלקת אשפוז פסיכיאטריה ג', ומנהל החטיבה הפסיכיאטרית. תחומי המחקר של פרופ' וייזר כוללים סכיזופרניה, בייחוד אפידמיולוגיה, קוגניציה וטיפול; הפרעות קשב וריכוז וליקויי למידה; ופסיכוגראטריה. הוא פרסם מאמרים בתחומים אילו בספרות המקצועית. כמו כן, פרופ' וייזר מנהל בשיבא את "מרכז הערכה" – יחידה בה נבדקים נכי צה"ל ומכינים חוות דעת לגביהם.